Les archives de Jean Vieujean couvrent ses activités tant scientifiques que religieuses et personnelles sur la période allant de 1921 à 1970. Elles sont constituées de documents généraux (documents biographiques, correspondances et carnets d'adresse) et de documents relatifs à son activité scientifique (publications, cours, conférences et des communications). Il y a également des documents concernant sa vie religieuse. Enfin, la dernière partie s'axe davantage sur son sacerdoce et sur sa vie privée. Elle est composée de documents plus personnels comme des notes de lecture ainsi que des souvenirs.