Jan Lerut est un éminent professeur de chirurgie, reconnu pour sa carrière professionnelle définit comme unique en son genre, puisqu'il travail dans sept environnements linguistiques et culturels différents (néerlandophones, francophones, germanophones, anglophones, italophones, polonais et sinophones).

Dès le début de sa carrière, il s'est impliqué dans le domaine de la transplantation d'organes et dans la chirurgie hépatobiliaire. Dans cet élan, il effectue un fellowship OTAN d'une durée de deux ans en hépatologie et transplantation à l'Université Paris-Sud dans le centre hépatobiliaire dirigé par le professeur Bismuth et aussi au Centre médical de l'Université de Pittsburgh sous la directive du Professeur Starzl.

De 1987 à 1991, il dirige le programme lié à la transplantation abdominale à l'Inselspital de Berne en Suisse.

Entre 1991 et 2016, il dirige l'unité de transplantation abdominale de Starzl à l'hôpital universitaire Saint-Luc et le Centre de transplantation UCL à Bruxelles.

Dans son travail, il tente d'oeuvrer au rapprochement des pratiques de transplantation hépatique entre Orient et Occident. Notamment dans le domaine de la transplantation hépatique pour le cancer hépatocellulaire par le biais de conférences et missions d'études avec la Chine, Hong-Kong, le Japon, la Corée du Sud et Taïwan.

Il préside la Société belge de transplantation (SBT) , la Société belge de chirurgie (SRB), le Comité d'attribution des greffons hépatiques d'Eurotransplant (ET-ELIAC), la Société européenne de transplantation d'organes (ESOT), et la Société internationale de transplantation hépatique (ILTS). Il fait également parti de l'UEMS-European Board of Transpantation Surgery (EBTS) et du Conseil supérieur de la santé de Belgique. A l'heure actuelle, il préside la Société internationale des chirurgiens du foie (ISLS).

Il est reconnu à l'échelle mondiale comme un expert dans le domaine de transplantation.

Il publie de nombreux articles, environ 381 articles sont publiés à son nom dans des revues à comité de lecture. Il participe aussi à l'élaboration d'ouvrages dont il est auteur de 31 chapitres ainsi que 25 films scientifiques. Grand orateur, il participe et organise plus d'une cinquantaine de congrès nationaux mais aussi internationaux consacré à la chirurgie général, hépatique et à la transplantation d'organes.

De part son prestige, il est un professeur invité dans de nombreuses institutions de renom et d'universités comme: la Mayo Clinic, Cleveland Clinic Foundation (Etat-Unis), les facultés de médecine de Tokyo; l'Universidade Sao Paulo; des universités LA Cattolica de Santiago du Chili (Californie), la Calle de Cali (colombie) et de Varsovie (Pologne); de l'hôpital spécialisé de Kaohsiung (Taiwan). Il est directeur honoraire de l'Institut de transplantation de l'hôpital international Shulan de l'Université du Zheijiang à Hangzhou (Chine).

Ses recherches portent sur le développement de techniques de transplantation hépatique, ainsi que l'oncologie de la transplantation. Il travail aussi sur la collaboration entre les mondes de la transplantation chirugicale en Orient et en Occident.